Основные направления научной деятельности А.А. Камалова посвящены проблемам консервативного и оперативного лечения урологических и андрологических заболеваний. Предложенные А.А.Камаловым высокотехнологичные малоинвазивные и эндоскопические методы позволили в значительной степени улучшить результаты лечения заболеваний предстательной железы, мужской уретры, мочевого пузыря и почек. А.А. Камаловым внедрены микрохирургические реконструктивно-пластические вмешательства с использованием свободного лоскута на сосудистой ножке в эксперименте и в клинической практике по поводу стриктур, облитераций, свищей мужской уретры.
Президент Общественной организации «Мужское здоровье», член комиссии Экспертного Совета РАМН по модернизации и инновационному развитию медицинской науки в области репродуктивного здоровья мужчин и урологии, Вице-президент Российского общества по эндоурологии и новым технологиям, член Европейского общества урологов, Международного эндоурологического общества, редколлегии журналов «Урология», «Men’sHealth», Вице-президент Международного движения «Врачи мира за предотвращение ядерной войны»